Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rcbtb2Q99LJ7 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rcbtb2Q99LJ7 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Rcbtb2Q99LJ7 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rcbtb2Q99LJ7 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rcbtb2Q99LJ7 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rcbtb2Q99LJ7 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rcbtb2Q99LJ7 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rcbtb2Q99LJ7 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rcbtb2Q99LJ7 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rcbtb2Q99LJ7 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rcbtb2Q99LJ7 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Rcbtb2Q99LJ7 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rcbtb2Q99LJ7 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rcbtb2Q99LJ7 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rcbtb2Q99LJ7 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rcbtb2Q99LJ7 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rcbtb2Q99LJ7 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rcbtb2Q99LJ7 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Rcbtb2Q99LJ7 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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