Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU6

Bombesin receptor-activated protein C6orf89 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99KU6 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Q99KU6 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q99KU6 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q99KU6 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Q99KU6 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q99KU6 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Q99KU6 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q99KU6 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q99KU6 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q99KU6 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q99KU6 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q99KU6 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q99KU6 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q99KU6 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q99KU6 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q99KU6 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q99KU6 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q99KU6 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q99KU6 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q99KU6 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q99KU6 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q99KU6 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q99KU6 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q99KU6 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Q99KU6 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q99KU6 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q99KU6 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q99KU6 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q99KU6 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q99KU6 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q99KU6 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q99KU6 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q99KU6 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q99KU6 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Q99KU6 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q99KU6 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q99KU6 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q99KU6 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Q99KU6 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Q99KU6 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q99KU6 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Q99KU6 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Q99KU6 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q99KU6 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q99KU6 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q99KU6 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q99KU6 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q99KU6 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q99KU6 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q99KU6 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q99KU6 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q99KU6 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q99KU6 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q99KU6 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q99KU6 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q99KU6 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q99KU6 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q99KU6 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q99KU6 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q99KU6 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q99KU6 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q99KU6 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q99KU6 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q99KU6 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q99KU6 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q99KU6 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q99KU6 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q99KU6 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q99KU6 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q99KU6 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q99KU6 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Q99KU6 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q99KU6 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q99KU6 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q99KU6 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q99KU6 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q99KU6 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Q99KU6 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q99KU6 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q99KU6 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q99KU6 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Q99KU6 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q99KU6 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q99KU6 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q99KU6 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q99KU6 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q99KU6 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q99KU6 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q99KU6 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q99KU6 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q99KU6 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q99KU6 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q99KU6 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q99KU6 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q99KU6 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q99KU6 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q99KU6 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Q99KU6 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q99KU6 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q99KU6 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms