Protein–RNA interactions for Protein: Q99K10

Nlgn1, Neuroligin-1, mousemouse

Predictions only

Length 843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlgn1Q99K10 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nlgn1Q99K10 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nlgn1Q99K10 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nlgn1Q99K10 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nlgn1Q99K10 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Nlgn1Q99K10 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nlgn1Q99K10 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nlgn1Q99K10 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Nlgn1Q99K10 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Nlgn1Q99K10 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Nlgn1Q99K10 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nlgn1Q99K10 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nlgn1Q99K10 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nlgn1Q99K10 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nlgn1Q99K10 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nlgn1Q99K10 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nlgn1Q99K10 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nlgn1Q99K10 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nlgn1Q99K10 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nlgn1Q99K10 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nlgn1Q99K10 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Nlgn1Q99K10 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nlgn1Q99K10 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Nlgn1Q99K10 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nlgn1Q99K10 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlgn1Q99K10 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlgn1Q99K10 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlgn1Q99K10 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlgn1Q99K10 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlgn1Q99K10 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlgn1Q99K10 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlgn1Q99K10 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlgn1Q99K10 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlgn1Q99K10 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlgn1Q99K10 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlgn1Q99K10 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlgn1Q99K10 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlgn1Q99K10 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlgn1Q99K10 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlgn1Q99K10 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlgn1Q99K10 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlgn1Q99K10 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlgn1Q99K10 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlgn1Q99K10 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlgn1Q99K10 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlgn1Q99K10 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlgn1Q99K10 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlgn1Q99K10 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nlgn1Q99K10 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nlgn1Q99K10 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nlgn1Q99K10 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nlgn1Q99K10 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nlgn1Q99K10 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nlgn1Q99K10 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nlgn1Q99K10 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nlgn1Q99K10 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nlgn1Q99K10 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nlgn1Q99K10 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nlgn1Q99K10 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Nlgn1Q99K10 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nlgn1Q99K10 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nlgn1Q99K10 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nlgn1Q99K10 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Nlgn1Q99K10 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Nlgn1Q99K10 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nlgn1Q99K10 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nlgn1Q99K10 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nlgn1Q99K10 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nlgn1Q99K10 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nlgn1Q99K10 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nlgn1Q99K10 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nlgn1Q99K10 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nlgn1Q99K10 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nlgn1Q99K10 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nlgn1Q99K10 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nlgn1Q99K10 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nlgn1Q99K10 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nlgn1Q99K10 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nlgn1Q99K10 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nlgn1Q99K10 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nlgn1Q99K10 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nlgn1Q99K10 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nlgn1Q99K10 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nlgn1Q99K10 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nlgn1Q99K10 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nlgn1Q99K10 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Nlgn1Q99K10 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nlgn1Q99K10 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nlgn1Q99K10 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nlgn1Q99K10 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nlgn1Q99K10 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nlgn1Q99K10 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nlgn1Q99K10 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nlgn1Q99K10 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Nlgn1Q99K10 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nlgn1Q99K10 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nlgn1Q99K10 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nlgn1Q99K10 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nlgn1Q99K10 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nlgn1Q99K10 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms