Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pacsin3Q99JB8 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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