Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Apobec3Q99J72 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Apobec3Q99J72 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms