Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smim11aQ99J19 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
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Smim11aQ99J19 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Smim11aQ99J19 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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