Protein–RNA interactions for Protein: Q921F2

Tardbp, TAR DNA-binding protein 43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TardbpQ921F2 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
TardbpQ921F2 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
TardbpQ921F2 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
TardbpQ921F2 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TardbpQ921F2 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TardbpQ921F2 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TardbpQ921F2 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TardbpQ921F2 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TardbpQ921F2 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TardbpQ921F2 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TardbpQ921F2 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TardbpQ921F2 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TardbpQ921F2 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TardbpQ921F2 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TardbpQ921F2 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TardbpQ921F2 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TardbpQ921F2 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TardbpQ921F2 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TardbpQ921F2 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TardbpQ921F2 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TardbpQ921F2 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TardbpQ921F2 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TardbpQ921F2 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TardbpQ921F2 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TardbpQ921F2 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TardbpQ921F2 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TardbpQ921F2 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TardbpQ921F2 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TardbpQ921F2 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TardbpQ921F2 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TardbpQ921F2 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TardbpQ921F2 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TardbpQ921F2 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TardbpQ921F2 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TardbpQ921F2 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TardbpQ921F2 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TardbpQ921F2 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TardbpQ921F2 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TardbpQ921F2 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TardbpQ921F2 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
TardbpQ921F2 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TardbpQ921F2 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TardbpQ921F2 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TardbpQ921F2 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
TardbpQ921F2 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TardbpQ921F2 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
TardbpQ921F2 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TardbpQ921F2 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TardbpQ921F2 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TardbpQ921F2 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
TardbpQ921F2 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TardbpQ921F2 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TardbpQ921F2 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TardbpQ921F2 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TardbpQ921F2 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
TardbpQ921F2 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TardbpQ921F2 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TardbpQ921F2 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TardbpQ921F2 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
TardbpQ921F2 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TardbpQ921F2 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
TardbpQ921F2 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TardbpQ921F2 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TardbpQ921F2 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TardbpQ921F2 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TardbpQ921F2 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TardbpQ921F2 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TardbpQ921F2 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TardbpQ921F2 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TardbpQ921F2 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TardbpQ921F2 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TardbpQ921F2 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TardbpQ921F2 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TardbpQ921F2 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TardbpQ921F2 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TardbpQ921F2 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TardbpQ921F2 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TardbpQ921F2 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TardbpQ921F2 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TardbpQ921F2 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
TardbpQ921F2 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
TardbpQ921F2 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TardbpQ921F2 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TardbpQ921F2 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TardbpQ921F2 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TardbpQ921F2 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TardbpQ921F2 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TardbpQ921F2 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TardbpQ921F2 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TardbpQ921F2 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TardbpQ921F2 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TardbpQ921F2 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TardbpQ921F2 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TardbpQ921F2 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TardbpQ921F2 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TardbpQ921F2 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TardbpQ921F2 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TardbpQ921F2 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TardbpQ921F2 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TardbpQ921F2 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms