Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Med28Q920D3 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms