Protein–RNA interactions for Protein: Q91W40

Klc3, Kinesin light chain 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc3Q91W40 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klc3Q91W40 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klc3Q91W40 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klc3Q91W40 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klc3Q91W40 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klc3Q91W40 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klc3Q91W40 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klc3Q91W40 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klc3Q91W40 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klc3Q91W40 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klc3Q91W40 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klc3Q91W40 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klc3Q91W40 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klc3Q91W40 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klc3Q91W40 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klc3Q91W40 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klc3Q91W40 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klc3Q91W40 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klc3Q91W40 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klc3Q91W40 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klc3Q91W40 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klc3Q91W40 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klc3Q91W40 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klc3Q91W40 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klc3Q91W40 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klc3Q91W40 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klc3Q91W40 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klc3Q91W40 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klc3Q91W40 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klc3Q91W40 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klc3Q91W40 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klc3Q91W40 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klc3Q91W40 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Klc3Q91W40 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klc3Q91W40 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klc3Q91W40 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klc3Q91W40 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klc3Q91W40 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Klc3Q91W40 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Klc3Q91W40 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Klc3Q91W40 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klc3Q91W40 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klc3Q91W40 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klc3Q91W40 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klc3Q91W40 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klc3Q91W40 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klc3Q91W40 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klc3Q91W40 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klc3Q91W40 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Klc3Q91W40 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Klc3Q91W40 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klc3Q91W40 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klc3Q91W40 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klc3Q91W40 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klc3Q91W40 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klc3Q91W40 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klc3Q91W40 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klc3Q91W40 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klc3Q91W40 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klc3Q91W40 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klc3Q91W40 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klc3Q91W40 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klc3Q91W40 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klc3Q91W40 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klc3Q91W40 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klc3Q91W40 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klc3Q91W40 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klc3Q91W40 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klc3Q91W40 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klc3Q91W40 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Klc3Q91W40 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Klc3Q91W40 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klc3Q91W40 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klc3Q91W40 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klc3Q91W40 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klc3Q91W40 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klc3Q91W40 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klc3Q91W40 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klc3Q91W40 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klc3Q91W40 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klc3Q91W40 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klc3Q91W40 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klc3Q91W40 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klc3Q91W40 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klc3Q91W40 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klc3Q91W40 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klc3Q91W40 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klc3Q91W40 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klc3Q91W40 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Klc3Q91W40 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klc3Q91W40 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klc3Q91W40 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klc3Q91W40 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms