Protein–RNA interactions for Protein: Q91VB4

Hps3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,002 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps3Q91VB4 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hps3Q91VB4 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70 ms