Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms