Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCQ6

Sgms1, Phosphatidylcholine:ceramide cholinephosphotransferase 1, mousemouse

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Length 419 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgms1Q8VCQ6 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Sgms1Q8VCQ6 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sgms1Q8VCQ6 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sgms1Q8VCQ6 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sgms1Q8VCQ6 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sgms1Q8VCQ6 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sgms1Q8VCQ6 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sgms1Q8VCQ6 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sgms1Q8VCQ6 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sgms1Q8VCQ6 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sgms1Q8VCQ6 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sgms1Q8VCQ6 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sgms1Q8VCQ6 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sgms1Q8VCQ6 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sgms1Q8VCQ6 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sgms1Q8VCQ6 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sgms1Q8VCQ6 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sgms1Q8VCQ6 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Sgms1Q8VCQ6 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Sgms1Q8VCQ6 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sgms1Q8VCQ6 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sgms1Q8VCQ6 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sgms1Q8VCQ6 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sgms1Q8VCQ6 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sgms1Q8VCQ6 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sgms1Q8VCQ6 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sgms1Q8VCQ6 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sgms1Q8VCQ6 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sgms1Q8VCQ6 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sgms1Q8VCQ6 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sgms1Q8VCQ6 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sgms1Q8VCQ6 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sgms1Q8VCQ6 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sgms1Q8VCQ6 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sgms1Q8VCQ6 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sgms1Q8VCQ6 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Sgms1Q8VCQ6 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Sgms1Q8VCQ6 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sgms1Q8VCQ6 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Sgms1Q8VCQ6 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sgms1Q8VCQ6 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sgms1Q8VCQ6 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sgms1Q8VCQ6 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Sgms1Q8VCQ6 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sgms1Q8VCQ6 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Sgms1Q8VCQ6 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sgms1Q8VCQ6 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Sgms1Q8VCQ6 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sgms1Q8VCQ6 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Sgms1Q8VCQ6 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Sgms1Q8VCQ6 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Sgms1Q8VCQ6 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Sgms1Q8VCQ6 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Sgms1Q8VCQ6 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sgms1Q8VCQ6 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sgms1Q8VCQ6 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sgms1Q8VCQ6 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sgms1Q8VCQ6 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sgms1Q8VCQ6 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sgms1Q8VCQ6 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Sgms1Q8VCQ6 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sgms1Q8VCQ6 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sgms1Q8VCQ6 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sgms1Q8VCQ6 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sgms1Q8VCQ6 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Sgms1Q8VCQ6 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sgms1Q8VCQ6 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sgms1Q8VCQ6 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sgms1Q8VCQ6 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sgms1Q8VCQ6 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Sgms1Q8VCQ6 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sgms1Q8VCQ6 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sgms1Q8VCQ6 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sgms1Q8VCQ6 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Sgms1Q8VCQ6 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Sgms1Q8VCQ6 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sgms1Q8VCQ6 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Sgms1Q8VCQ6 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sgms1Q8VCQ6 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sgms1Q8VCQ6 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sgms1Q8VCQ6 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sgms1Q8VCQ6 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sgms1Q8VCQ6 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sgms1Q8VCQ6 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sgms1Q8VCQ6 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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