Protein–RNA interactions for Protein: Q8R332

Nup58, Nucleoporin p58/p45, mousemouse

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Length 587 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup58Q8R332 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Nup58Q8R332 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Nup58Q8R332 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Nup58Q8R332 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Nup58Q8R332 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nup58Q8R332 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Nup58Q8R332 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Nup58Q8R332 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Nup58Q8R332 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup58Q8R332 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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