Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2Q0

Trim29, Tripartite motif-containing protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim29Q8R2Q0 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim29Q8R2Q0 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim29Q8R2Q0 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim29Q8R2Q0 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim29Q8R2Q0 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim29Q8R2Q0 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim29Q8R2Q0 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim29Q8R2Q0 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim29Q8R2Q0 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim29Q8R2Q0 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim29Q8R2Q0 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim29Q8R2Q0 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim29Q8R2Q0 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim29Q8R2Q0 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim29Q8R2Q0 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim29Q8R2Q0 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim29Q8R2Q0 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim29Q8R2Q0 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim29Q8R2Q0 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim29Q8R2Q0 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim29Q8R2Q0 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim29Q8R2Q0 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim29Q8R2Q0 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim29Q8R2Q0 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim29Q8R2Q0 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim29Q8R2Q0 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim29Q8R2Q0 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim29Q8R2Q0 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim29Q8R2Q0 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim29Q8R2Q0 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim29Q8R2Q0 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim29Q8R2Q0 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim29Q8R2Q0 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim29Q8R2Q0 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim29Q8R2Q0 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim29Q8R2Q0 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim29Q8R2Q0 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim29Q8R2Q0 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim29Q8R2Q0 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim29Q8R2Q0 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim29Q8R2Q0 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim29Q8R2Q0 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim29Q8R2Q0 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim29Q8R2Q0 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim29Q8R2Q0 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim29Q8R2Q0 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim29Q8R2Q0 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim29Q8R2Q0 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim29Q8R2Q0 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim29Q8R2Q0 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim29Q8R2Q0 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim29Q8R2Q0 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim29Q8R2Q0 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim29Q8R2Q0 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim29Q8R2Q0 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim29Q8R2Q0 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim29Q8R2Q0 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim29Q8R2Q0 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim29Q8R2Q0 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim29Q8R2Q0 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim29Q8R2Q0 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim29Q8R2Q0 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim29Q8R2Q0 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim29Q8R2Q0 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim29Q8R2Q0 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim29Q8R2Q0 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim29Q8R2Q0 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim29Q8R2Q0 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim29Q8R2Q0 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim29Q8R2Q0 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim29Q8R2Q0 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim29Q8R2Q0 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim29Q8R2Q0 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim29Q8R2Q0 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim29Q8R2Q0 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim29Q8R2Q0 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim29Q8R2Q0 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim29Q8R2Q0 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim29Q8R2Q0 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim29Q8R2Q0 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim29Q8R2Q0 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim29Q8R2Q0 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim29Q8R2Q0 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim29Q8R2Q0 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim29Q8R2Q0 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim29Q8R2Q0 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim29Q8R2Q0 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim29Q8R2Q0 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim29Q8R2Q0 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim29Q8R2Q0 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim29Q8R2Q0 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim29Q8R2Q0 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim29Q8R2Q0 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim29Q8R2Q0 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim29Q8R2Q0 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim29Q8R2Q0 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim29Q8R2Q0 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim29Q8R2Q0 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim29Q8R2Q0 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim29Q8R2Q0 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms