Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0W1

Cipc, CLOCK-interacting pacemaker, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CipcQ8R0W1 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
CipcQ8R0W1 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
CipcQ8R0W1 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
CipcQ8R0W1 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CipcQ8R0W1 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CipcQ8R0W1 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CipcQ8R0W1 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CipcQ8R0W1 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CipcQ8R0W1 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CipcQ8R0W1 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CipcQ8R0W1 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CipcQ8R0W1 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CipcQ8R0W1 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CipcQ8R0W1 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CipcQ8R0W1 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CipcQ8R0W1 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CipcQ8R0W1 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CipcQ8R0W1 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CipcQ8R0W1 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CipcQ8R0W1 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CipcQ8R0W1 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CipcQ8R0W1 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CipcQ8R0W1 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
CipcQ8R0W1 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CipcQ8R0W1 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CipcQ8R0W1 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CipcQ8R0W1 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CipcQ8R0W1 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CipcQ8R0W1 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CipcQ8R0W1 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CipcQ8R0W1 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CipcQ8R0W1 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CipcQ8R0W1 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CipcQ8R0W1 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CipcQ8R0W1 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CipcQ8R0W1 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CipcQ8R0W1 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CipcQ8R0W1 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CipcQ8R0W1 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CipcQ8R0W1 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CipcQ8R0W1 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CipcQ8R0W1 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
CipcQ8R0W1 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CipcQ8R0W1 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CipcQ8R0W1 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CipcQ8R0W1 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CipcQ8R0W1 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CipcQ8R0W1 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CipcQ8R0W1 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CipcQ8R0W1 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CipcQ8R0W1 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CipcQ8R0W1 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CipcQ8R0W1 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CipcQ8R0W1 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CipcQ8R0W1 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CipcQ8R0W1 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CipcQ8R0W1 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CipcQ8R0W1 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
CipcQ8R0W1 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CipcQ8R0W1 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CipcQ8R0W1 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
CipcQ8R0W1 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
CipcQ8R0W1 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CipcQ8R0W1 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CipcQ8R0W1 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
CipcQ8R0W1 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CipcQ8R0W1 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CipcQ8R0W1 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CipcQ8R0W1 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CipcQ8R0W1 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CipcQ8R0W1 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CipcQ8R0W1 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CipcQ8R0W1 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CipcQ8R0W1 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CipcQ8R0W1 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CipcQ8R0W1 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CipcQ8R0W1 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CipcQ8R0W1 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CipcQ8R0W1 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CipcQ8R0W1 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CipcQ8R0W1 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CipcQ8R0W1 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CipcQ8R0W1 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CipcQ8R0W1 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CipcQ8R0W1 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CipcQ8R0W1 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CipcQ8R0W1 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CipcQ8R0W1 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CipcQ8R0W1 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CipcQ8R0W1 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CipcQ8R0W1 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CipcQ8R0W1 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CipcQ8R0W1 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CipcQ8R0W1 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CipcQ8R0W1 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CipcQ8R0W1 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CipcQ8R0W1 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CipcQ8R0W1 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CipcQ8R0W1 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
CipcQ8R0W1 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
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