Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc12Q8K2L8 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc12Q8K2L8 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc12Q8K2L8 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc12Q8K2L8 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc12Q8K2L8 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc12Q8K2L8 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc12Q8K2L8 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc12Q8K2L8 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc12Q8K2L8 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc12Q8K2L8 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc12Q8K2L8 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc12Q8K2L8 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc12Q8K2L8 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc12Q8K2L8 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc12Q8K2L8 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc12Q8K2L8 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc12Q8K2L8 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc12Q8K2L8 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc12Q8K2L8 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc12Q8K2L8 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc12Q8K2L8 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc12Q8K2L8 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc12Q8K2L8 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc12Q8K2L8 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc12Q8K2L8 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc12Q8K2L8 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc12Q8K2L8 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc12Q8K2L8 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms