Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms