Protein–RNA interactions for Protein: Q8K299

Scara5, Scavenger receptor class A member 5, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scara5Q8K299 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scara5Q8K299 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scara5Q8K299 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scara5Q8K299 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scara5Q8K299 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scara5Q8K299 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scara5Q8K299 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scara5Q8K299 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Scara5Q8K299 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scara5Q8K299 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scara5Q8K299 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scara5Q8K299 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scara5Q8K299 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scara5Q8K299 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scara5Q8K299 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scara5Q8K299 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Scara5Q8K299 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Scara5Q8K299 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scara5Q8K299 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scara5Q8K299 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Scara5Q8K299 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scara5Q8K299 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scara5Q8K299 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scara5Q8K299 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scara5Q8K299 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scara5Q8K299 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scara5Q8K299 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scara5Q8K299 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scara5Q8K299 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scara5Q8K299 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scara5Q8K299 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scara5Q8K299 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scara5Q8K299 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scara5Q8K299 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Scara5Q8K299 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scara5Q8K299 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Scara5Q8K299 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scara5Q8K299 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scara5Q8K299 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Scara5Q8K299 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scara5Q8K299 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Scara5Q8K299 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Scara5Q8K299 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scara5Q8K299 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scara5Q8K299 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scara5Q8K299 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scara5Q8K299 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scara5Q8K299 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Scara5Q8K299 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scara5Q8K299 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scara5Q8K299 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scara5Q8K299 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scara5Q8K299 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scara5Q8K299 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scara5Q8K299 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scara5Q8K299 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scara5Q8K299 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scara5Q8K299 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scara5Q8K299 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scara5Q8K299 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Scara5Q8K299 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scara5Q8K299 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scara5Q8K299 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scara5Q8K299 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scara5Q8K299 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scara5Q8K299 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scara5Q8K299 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Scara5Q8K299 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scara5Q8K299 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scara5Q8K299 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
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Scara5Q8K299 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scara5Q8K299 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scara5Q8K299 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scara5Q8K299 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Scara5Q8K299 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Scara5Q8K299 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Scara5Q8K299 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scara5Q8K299 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scara5Q8K299 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scara5Q8K299 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scara5Q8K299 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scara5Q8K299 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scara5Q8K299 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scara5Q8K299 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scara5Q8K299 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scara5Q8K299 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scara5Q8K299 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scara5Q8K299 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scara5Q8K299 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scara5Q8K299 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scara5Q8K299 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scara5Q8K299 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scara5Q8K299 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scara5Q8K299 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scara5Q8K299 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Scara5Q8K299 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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