Protein–RNA interactions for Protein: Q8K284

Gtf3c1, General transcription factor 3C polypeptide 1, mousemouse

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Length 2,101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c1Q8K284 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Gtf3c1Q8K284 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Gtf3c1Q8K284 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gtf3c1Q8K284 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Gtf3c1Q8K284 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gtf3c1Q8K284 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gtf3c1Q8K284 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gtf3c1Q8K284 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gtf3c1Q8K284 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gtf3c1Q8K284 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gtf3c1Q8K284 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gtf3c1Q8K284 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gtf3c1Q8K284 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gtf3c1Q8K284 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gtf3c1Q8K284 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gtf3c1Q8K284 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gtf3c1Q8K284 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gtf3c1Q8K284 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gtf3c1Q8K284 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gtf3c1Q8K284 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gtf3c1Q8K284 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gtf3c1Q8K284 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gtf3c1Q8K284 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gtf3c1Q8K284 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gtf3c1Q8K284 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gtf3c1Q8K284 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gtf3c1Q8K284 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gtf3c1Q8K284 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gtf3c1Q8K284 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gtf3c1Q8K284 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gtf3c1Q8K284 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gtf3c1Q8K284 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gtf3c1Q8K284 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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