Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFZ4

Gpc3, Glypican-3, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc3Q8CFZ4 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gpc3Q8CFZ4 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gpc3Q8CFZ4 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gpc3Q8CFZ4 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gpc3Q8CFZ4 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gpc3Q8CFZ4 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gpc3Q8CFZ4 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gpc3Q8CFZ4 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gpc3Q8CFZ4 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gpc3Q8CFZ4 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gpc3Q8CFZ4 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gpc3Q8CFZ4 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gpc3Q8CFZ4 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gpc3Q8CFZ4 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gpc3Q8CFZ4 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gpc3Q8CFZ4 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gpc3Q8CFZ4 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gpc3Q8CFZ4 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gpc3Q8CFZ4 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gpc3Q8CFZ4 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gpc3Q8CFZ4 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gpc3Q8CFZ4 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gpc3Q8CFZ4 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gpc3Q8CFZ4 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gpc3Q8CFZ4 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gpc3Q8CFZ4 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gpc3Q8CFZ4 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gpc3Q8CFZ4 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gpc3Q8CFZ4 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gpc3Q8CFZ4 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gpc3Q8CFZ4 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gpc3Q8CFZ4 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gpc3Q8CFZ4 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gpc3Q8CFZ4 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gpc3Q8CFZ4 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gpc3Q8CFZ4 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gpc3Q8CFZ4 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gpc3Q8CFZ4 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gpc3Q8CFZ4 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gpc3Q8CFZ4 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gpc3Q8CFZ4 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gpc3Q8CFZ4 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gpc3Q8CFZ4 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gpc3Q8CFZ4 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gpc3Q8CFZ4 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gpc3Q8CFZ4 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gpc3Q8CFZ4 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gpc3Q8CFZ4 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gpc3Q8CFZ4 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gpc3Q8CFZ4 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gpc3Q8CFZ4 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gpc3Q8CFZ4 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gpc3Q8CFZ4 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gpc3Q8CFZ4 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gpc3Q8CFZ4 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gpc3Q8CFZ4 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gpc3Q8CFZ4 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gpc3Q8CFZ4 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gpc3Q8CFZ4 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gpc3Q8CFZ4 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gpc3Q8CFZ4 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gpc3Q8CFZ4 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gpc3Q8CFZ4 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gpc3Q8CFZ4 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gpc3Q8CFZ4 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gpc3Q8CFZ4 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gpc3Q8CFZ4 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gpc3Q8CFZ4 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gpc3Q8CFZ4 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gpc3Q8CFZ4 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gpc3Q8CFZ4 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gpc3Q8CFZ4 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gpc3Q8CFZ4 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gpc3Q8CFZ4 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gpc3Q8CFZ4 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gpc3Q8CFZ4 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gpc3Q8CFZ4 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gpc3Q8CFZ4 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gpc3Q8CFZ4 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gpc3Q8CFZ4 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gpc3Q8CFZ4 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gpc3Q8CFZ4 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gpc3Q8CFZ4 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gpc3Q8CFZ4 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gpc3Q8CFZ4 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gpc3Q8CFZ4 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gpc3Q8CFZ4 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gpc3Q8CFZ4 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gpc3Q8CFZ4 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gpc3Q8CFZ4 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gpc3Q8CFZ4 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gpc3Q8CFZ4 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gpc3Q8CFZ4 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gpc3Q8CFZ4 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gpc3Q8CFZ4 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gpc3Q8CFZ4 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gpc3Q8CFZ4 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gpc3Q8CFZ4 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gpc3Q8CFZ4 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gpc3Q8CFZ4 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms