Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hpf1Q8CFE2 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms