Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEE7

Rdh13, Retinol dehydrogenase 13, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh13Q8CEE7 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Rdh13Q8CEE7 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rdh13Q8CEE7 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rdh13Q8CEE7 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rdh13Q8CEE7 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rdh13Q8CEE7 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rdh13Q8CEE7 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rdh13Q8CEE7 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rdh13Q8CEE7 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rdh13Q8CEE7 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rdh13Q8CEE7 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rdh13Q8CEE7 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rdh13Q8CEE7 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdh13Q8CEE7 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdh13Q8CEE7 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdh13Q8CEE7 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdh13Q8CEE7 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdh13Q8CEE7 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdh13Q8CEE7 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdh13Q8CEE7 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdh13Q8CEE7 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdh13Q8CEE7 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdh13Q8CEE7 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdh13Q8CEE7 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdh13Q8CEE7 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdh13Q8CEE7 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Rdh13Q8CEE7 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdh13Q8CEE7 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdh13Q8CEE7 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdh13Q8CEE7 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdh13Q8CEE7 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdh13Q8CEE7 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdh13Q8CEE7 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdh13Q8CEE7 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdh13Q8CEE7 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdh13Q8CEE7 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdh13Q8CEE7 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdh13Q8CEE7 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdh13Q8CEE7 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdh13Q8CEE7 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdh13Q8CEE7 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Rdh13Q8CEE7 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdh13Q8CEE7 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdh13Q8CEE7 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdh13Q8CEE7 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Rdh13Q8CEE7 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rdh13Q8CEE7 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rdh13Q8CEE7 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Rdh13Q8CEE7 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rdh13Q8CEE7 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rdh13Q8CEE7 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rdh13Q8CEE7 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rdh13Q8CEE7 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rdh13Q8CEE7 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Rdh13Q8CEE7 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Rdh13Q8CEE7 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Rdh13Q8CEE7 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
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Rdh13Q8CEE7 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Rdh13Q8CEE7 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Rdh13Q8CEE7 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Rdh13Q8CEE7 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Rdh13Q8CEE7 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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