Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD92

Ttc27, Tetratricopeptide repeat protein 27, mousemouse

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Length 847 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc27Q8CD92 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc27Q8CD92 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc27Q8CD92 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Ttc27Q8CD92 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc27Q8CD92 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Ttc27Q8CD92 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Ttc27Q8CD92 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc27Q8CD92 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc27Q8CD92 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc27Q8CD92 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Ttc27Q8CD92 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Ttc27Q8CD92 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ttc27Q8CD92 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ttc27Q8CD92 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ttc27Q8CD92 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ttc27Q8CD92 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ttc27Q8CD92 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ttc27Q8CD92 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ttc27Q8CD92 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ttc27Q8CD92 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ttc27Q8CD92 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ttc27Q8CD92 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ttc27Q8CD92 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ttc27Q8CD92 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms