Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5V8

Ccdc187, Coiled-coil domain-containing protein 187, mousemouse

Predictions only

Length 958 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc187Q8C5V8 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc187Q8C5V8 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc187Q8C5V8 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc187Q8C5V8 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc187Q8C5V8 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc187Q8C5V8 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc187Q8C5V8 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc187Q8C5V8 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc187Q8C5V8 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc187Q8C5V8 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc187Q8C5V8 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc187Q8C5V8 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc187Q8C5V8 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc187Q8C5V8 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc187Q8C5V8 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc187Q8C5V8 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc187Q8C5V8 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc187Q8C5V8 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc187Q8C5V8 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc187Q8C5V8 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc187Q8C5V8 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccdc187Q8C5V8 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccdc187Q8C5V8 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccdc187Q8C5V8 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccdc187Q8C5V8 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccdc187Q8C5V8 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc187Q8C5V8 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms