Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccser1Q8C0C4 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccser1Q8C0C4 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccser1Q8C0C4 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccser1Q8C0C4 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccser1Q8C0C4 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccser1Q8C0C4 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccser1Q8C0C4 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ccser1Q8C0C4 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Ccser1Q8C0C4 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccser1Q8C0C4 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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