Protein–RNA interactions for Protein: Q8BZW8

Nhlrc2, NHL repeat-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc2Q8BZW8 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nhlrc2Q8BZW8 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nhlrc2Q8BZW8 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nhlrc2Q8BZW8 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nhlrc2Q8BZW8 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nhlrc2Q8BZW8 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nhlrc2Q8BZW8 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Nhlrc2Q8BZW8 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nhlrc2Q8BZW8 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nhlrc2Q8BZW8 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nhlrc2Q8BZW8 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Nhlrc2Q8BZW8 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nhlrc2Q8BZW8 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nhlrc2Q8BZW8 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nhlrc2Q8BZW8 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nhlrc2Q8BZW8 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nhlrc2Q8BZW8 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nhlrc2Q8BZW8 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nhlrc2Q8BZW8 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nhlrc2Q8BZW8 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nhlrc2Q8BZW8 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nhlrc2Q8BZW8 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nhlrc2Q8BZW8 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nhlrc2Q8BZW8 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nhlrc2Q8BZW8 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nhlrc2Q8BZW8 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nhlrc2Q8BZW8 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nhlrc2Q8BZW8 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nhlrc2Q8BZW8 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nhlrc2Q8BZW8 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nhlrc2Q8BZW8 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Nhlrc2Q8BZW8 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Nhlrc2Q8BZW8 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Nhlrc2Q8BZW8 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Nhlrc2Q8BZW8 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Nhlrc2Q8BZW8 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Nhlrc2Q8BZW8 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Nhlrc2Q8BZW8 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Nhlrc2Q8BZW8 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Nhlrc2Q8BZW8 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Nhlrc2Q8BZW8 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Nhlrc2Q8BZW8 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Nhlrc2Q8BZW8 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Nhlrc2Q8BZW8 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Nhlrc2Q8BZW8 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Nhlrc2Q8BZW8 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms