Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ctdsp2Q8BX07 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ctdsp2Q8BX07 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ctdsp2Q8BX07 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ctdsp2Q8BX07 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ctdsp2Q8BX07 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ctdsp2Q8BX07 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ctdsp2Q8BX07 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Ctdsp2Q8BX07 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ctdsp2Q8BX07 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ctdsp2Q8BX07 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ctdsp2Q8BX07 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ctdsp2Q8BX07 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ctdsp2Q8BX07 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ctdsp2Q8BX07 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ctdsp2Q8BX07 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ctdsp2Q8BX07 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ctdsp2Q8BX07 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ctdsp2Q8BX07 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ctdsp2Q8BX07 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ctdsp2Q8BX07 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ctdsp2Q8BX07 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ctdsp2Q8BX07 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ctdsp2Q8BX07 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ctdsp2Q8BX07 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ctdsp2Q8BX07 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ctdsp2Q8BX07 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ctdsp2Q8BX07 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ctdsp2Q8BX07 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ctdsp2Q8BX07 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ctdsp2Q8BX07 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Ctdsp2Q8BX07 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Ctdsp2Q8BX07 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Ctdsp2Q8BX07 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Ctdsp2Q8BX07 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Ctdsp2Q8BX07 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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Ctdsp2Q8BX07 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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Ctdsp2Q8BX07 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ctdsp2Q8BX07 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
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Ctdsp2Q8BX07 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
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