Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWP5

Ttpa, Alpha-tocopherol transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtpaQ8BWP5 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TtpaQ8BWP5 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TtpaQ8BWP5 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TtpaQ8BWP5 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TtpaQ8BWP5 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TtpaQ8BWP5 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TtpaQ8BWP5 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TtpaQ8BWP5 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TtpaQ8BWP5 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TtpaQ8BWP5 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TtpaQ8BWP5 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TtpaQ8BWP5 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TtpaQ8BWP5 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TtpaQ8BWP5 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TtpaQ8BWP5 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TtpaQ8BWP5 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TtpaQ8BWP5 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TtpaQ8BWP5 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TtpaQ8BWP5 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TtpaQ8BWP5 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TtpaQ8BWP5 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TtpaQ8BWP5 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TtpaQ8BWP5 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TtpaQ8BWP5 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TtpaQ8BWP5 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TtpaQ8BWP5 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TtpaQ8BWP5 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TtpaQ8BWP5 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TtpaQ8BWP5 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TtpaQ8BWP5 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TtpaQ8BWP5 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TtpaQ8BWP5 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TtpaQ8BWP5 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TtpaQ8BWP5 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TtpaQ8BWP5 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TtpaQ8BWP5 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TtpaQ8BWP5 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TtpaQ8BWP5 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
TtpaQ8BWP5 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TtpaQ8BWP5 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TtpaQ8BWP5 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TtpaQ8BWP5 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
TtpaQ8BWP5 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
TtpaQ8BWP5 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
TtpaQ8BWP5 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TtpaQ8BWP5 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TtpaQ8BWP5 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TtpaQ8BWP5 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
TtpaQ8BWP5 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TtpaQ8BWP5 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TtpaQ8BWP5 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TtpaQ8BWP5 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TtpaQ8BWP5 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TtpaQ8BWP5 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TtpaQ8BWP5 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TtpaQ8BWP5 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TtpaQ8BWP5 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TtpaQ8BWP5 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TtpaQ8BWP5 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TtpaQ8BWP5 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TtpaQ8BWP5 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TtpaQ8BWP5 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TtpaQ8BWP5 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TtpaQ8BWP5 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TtpaQ8BWP5 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TtpaQ8BWP5 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TtpaQ8BWP5 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TtpaQ8BWP5 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TtpaQ8BWP5 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TtpaQ8BWP5 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TtpaQ8BWP5 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TtpaQ8BWP5 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TtpaQ8BWP5 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
TtpaQ8BWP5 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TtpaQ8BWP5 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TtpaQ8BWP5 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TtpaQ8BWP5 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TtpaQ8BWP5 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
TtpaQ8BWP5 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
TtpaQ8BWP5 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
TtpaQ8BWP5 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TtpaQ8BWP5 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
TtpaQ8BWP5 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TtpaQ8BWP5 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TtpaQ8BWP5 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TtpaQ8BWP5 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TtpaQ8BWP5 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TtpaQ8BWP5 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
TtpaQ8BWP5 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TtpaQ8BWP5 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TtpaQ8BWP5 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TtpaQ8BWP5 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TtpaQ8BWP5 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TtpaQ8BWP5 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TtpaQ8BWP5 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TtpaQ8BWP5 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
TtpaQ8BWP5 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TtpaQ8BWP5 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TtpaQ8BWP5 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TtpaQ8BWP5 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms