Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdcl3Q8BVF2 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdcl3Q8BVF2 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdcl3Q8BVF2 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdcl3Q8BVF2 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdcl3Q8BVF2 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdcl3Q8BVF2 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdcl3Q8BVF2 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdcl3Q8BVF2 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdcl3Q8BVF2 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdcl3Q8BVF2 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdcl3Q8BVF2 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdcl3Q8BVF2 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdcl3Q8BVF2 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdcl3Q8BVF2 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdcl3Q8BVF2 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdcl3Q8BVF2 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pdcl3Q8BVF2 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pdcl3Q8BVF2 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pdcl3Q8BVF2 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pdcl3Q8BVF2 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pdcl3Q8BVF2 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pdcl3Q8BVF2 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms