Protein–RNA interactions for Protein: Q8BT07

Cep55, Centrosomal protein of 55 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep55Q8BT07 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cep55Q8BT07 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cep55Q8BT07 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cep55Q8BT07 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms