Protein–RNA interactions for Protein: Q8BP99

UPF0500 protein C1orf216 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BP99 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q8BP99 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q8BP99 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q8BP99 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q8BP99 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q8BP99 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Q8BP99 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q8BP99 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q8BP99 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q8BP99 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q8BP99 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q8BP99 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q8BP99 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q8BP99 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Q8BP99 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q8BP99 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q8BP99 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q8BP99 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q8BP99 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q8BP99 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q8BP99 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q8BP99 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q8BP99 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q8BP99 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q8BP99 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q8BP99 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q8BP99 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q8BP99 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Q8BP99 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q8BP99 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q8BP99 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q8BP99 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q8BP99 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q8BP99 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q8BP99 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q8BP99 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q8BP99 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q8BP99 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Q8BP99 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q8BP99 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q8BP99 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q8BP99 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q8BP99 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q8BP99 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q8BP99 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q8BP99 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q8BP99 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q8BP99 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q8BP99 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q8BP99 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Q8BP99 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q8BP99 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q8BP99 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q8BP99 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q8BP99 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q8BP99 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q8BP99 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q8BP99 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q8BP99 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q8BP99 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q8BP99 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Q8BP99 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q8BP99 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q8BP99 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Q8BP99 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q8BP99 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q8BP99 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q8BP99 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Q8BP99 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q8BP99 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q8BP99 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q8BP99 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q8BP99 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Q8BP99 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Q8BP99 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Q8BP99 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Q8BP99 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Q8BP99 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Q8BP99 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q8BP99 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q8BP99 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q8BP99 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q8BP99 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q8BP99 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q8BP99 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q8BP99 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q8BP99 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q8BP99 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q8BP99 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q8BP99 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q8BP99 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q8BP99 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q8BP99 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q8BP99 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q8BP99 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q8BP99 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Q8BP99 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q8BP99 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Q8BP99 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Q8BP99 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms