Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH01

Tmco3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco3Q8BH01 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmco3Q8BH01 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmco3Q8BH01 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmco3Q8BH01 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmco3Q8BH01 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmco3Q8BH01 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmco3Q8BH01 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmco3Q8BH01 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmco3Q8BH01 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmco3Q8BH01 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmco3Q8BH01 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmco3Q8BH01 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmco3Q8BH01 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmco3Q8BH01 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmco3Q8BH01 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmco3Q8BH01 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmco3Q8BH01 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmco3Q8BH01 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmco3Q8BH01 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmco3Q8BH01 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmco3Q8BH01 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmco3Q8BH01 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmco3Q8BH01 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmco3Q8BH01 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmco3Q8BH01 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmco3Q8BH01 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmco3Q8BH01 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmco3Q8BH01 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmco3Q8BH01 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmco3Q8BH01 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmco3Q8BH01 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmco3Q8BH01 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmco3Q8BH01 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmco3Q8BH01 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmco3Q8BH01 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmco3Q8BH01 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmco3Q8BH01 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmco3Q8BH01 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmco3Q8BH01 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmco3Q8BH01 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmco3Q8BH01 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmco3Q8BH01 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmco3Q8BH01 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmco3Q8BH01 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmco3Q8BH01 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmco3Q8BH01 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmco3Q8BH01 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmco3Q8BH01 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmco3Q8BH01 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmco3Q8BH01 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmco3Q8BH01 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmco3Q8BH01 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmco3Q8BH01 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmco3Q8BH01 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmco3Q8BH01 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmco3Q8BH01 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmco3Q8BH01 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmco3Q8BH01 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmco3Q8BH01 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmco3Q8BH01 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmco3Q8BH01 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmco3Q8BH01 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmco3Q8BH01 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmco3Q8BH01 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmco3Q8BH01 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmco3Q8BH01 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmco3Q8BH01 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmco3Q8BH01 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmco3Q8BH01 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmco3Q8BH01 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmco3Q8BH01 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmco3Q8BH01 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmco3Q8BH01 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmco3Q8BH01 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmco3Q8BH01 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmco3Q8BH01 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmco3Q8BH01 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmco3Q8BH01 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmco3Q8BH01 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmco3Q8BH01 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmco3Q8BH01 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmco3Q8BH01 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmco3Q8BH01 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmco3Q8BH01 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmco3Q8BH01 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmco3Q8BH01 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmco3Q8BH01 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmco3Q8BH01 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmco3Q8BH01 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmco3Q8BH01 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmco3Q8BH01 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmco3Q8BH01 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmco3Q8BH01 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmco3Q8BH01 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmco3Q8BH01 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmco3Q8BH01 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmco3Q8BH01 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmco3Q8BH01 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmco3Q8BH01 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmco3Q8BH01 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms