Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
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Atg4bQ8BGE6 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atg4bQ8BGE6 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms