Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc172Q810N9 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms