Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms