Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZF2

Ifne, Interferon epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IfneQ80ZF2 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
IfneQ80ZF2 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
IfneQ80ZF2 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
IfneQ80ZF2 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
IfneQ80ZF2 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
IfneQ80ZF2 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
IfneQ80ZF2 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
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IfneQ80ZF2 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
IfneQ80ZF2 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
IfneQ80ZF2 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
IfneQ80ZF2 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
IfneQ80ZF2 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
IfneQ80ZF2 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
IfneQ80ZF2 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
IfneQ80ZF2 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
IfneQ80ZF2 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
IfneQ80ZF2 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
IfneQ80ZF2 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
IfneQ80ZF2 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
IfneQ80ZF2 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
IfneQ80ZF2 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
IfneQ80ZF2 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
IfneQ80ZF2 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
IfneQ80ZF2 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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IfneQ80ZF2 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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IfneQ80ZF2 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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IfneQ80ZF2 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
IfneQ80ZF2 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
IfneQ80ZF2 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
IfneQ80ZF2 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
IfneQ80ZF2 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
IfneQ80ZF2 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
IfneQ80ZF2 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
IfneQ80ZF2 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
IfneQ80ZF2 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
IfneQ80ZF2 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
IfneQ80ZF2 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
IfneQ80ZF2 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
IfneQ80ZF2 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
IfneQ80ZF2 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
IfneQ80ZF2 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
IfneQ80ZF2 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
IfneQ80ZF2 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
IfneQ80ZF2 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
IfneQ80ZF2 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
IfneQ80ZF2 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
IfneQ80ZF2 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
IfneQ80ZF2 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
IfneQ80ZF2 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
IfneQ80ZF2 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
IfneQ80ZF2 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
IfneQ80ZF2 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
IfneQ80ZF2 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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IfneQ80ZF2 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
IfneQ80ZF2 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
IfneQ80ZF2 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
IfneQ80ZF2 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
IfneQ80ZF2 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
IfneQ80ZF2 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
IfneQ80ZF2 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
IfneQ80ZF2 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
IfneQ80ZF2 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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IfneQ80ZF2 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
IfneQ80ZF2 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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IfneQ80ZF2 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
IfneQ80ZF2 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
IfneQ80ZF2 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
IfneQ80ZF2 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
IfneQ80ZF2 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
IfneQ80ZF2 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
IfneQ80ZF2 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
IfneQ80ZF2 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
IfneQ80ZF2 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
IfneQ80ZF2 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
IfneQ80ZF2 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
IfneQ80ZF2 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
IfneQ80ZF2 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
IfneQ80ZF2 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
IfneQ80ZF2 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
IfneQ80ZF2 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
IfneQ80ZF2 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
IfneQ80ZF2 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
IfneQ80ZF2 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
IfneQ80ZF2 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
IfneQ80ZF2 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
IfneQ80ZF2 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
IfneQ80ZF2 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
IfneQ80ZF2 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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