Protein–RNA interactions for Protein: Q80UU2

Rpp38, Ribonuclease P protein subunit p38, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpp38Q80UU2 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpp38Q80UU2 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpp38Q80UU2 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpp38Q80UU2 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpp38Q80UU2 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpp38Q80UU2 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpp38Q80UU2 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpp38Q80UU2 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpp38Q80UU2 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpp38Q80UU2 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpp38Q80UU2 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpp38Q80UU2 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpp38Q80UU2 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpp38Q80UU2 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpp38Q80UU2 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpp38Q80UU2 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpp38Q80UU2 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpp38Q80UU2 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpp38Q80UU2 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpp38Q80UU2 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpp38Q80UU2 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpp38Q80UU2 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpp38Q80UU2 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpp38Q80UU2 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpp38Q80UU2 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpp38Q80UU2 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpp38Q80UU2 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpp38Q80UU2 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpp38Q80UU2 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpp38Q80UU2 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpp38Q80UU2 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpp38Q80UU2 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpp38Q80UU2 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpp38Q80UU2 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpp38Q80UU2 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpp38Q80UU2 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpp38Q80UU2 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpp38Q80UU2 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpp38Q80UU2 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpp38Q80UU2 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpp38Q80UU2 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpp38Q80UU2 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpp38Q80UU2 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpp38Q80UU2 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpp38Q80UU2 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpp38Q80UU2 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpp38Q80UU2 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpp38Q80UU2 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpp38Q80UU2 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpp38Q80UU2 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpp38Q80UU2 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpp38Q80UU2 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpp38Q80UU2 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpp38Q80UU2 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpp38Q80UU2 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpp38Q80UU2 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpp38Q80UU2 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpp38Q80UU2 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpp38Q80UU2 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpp38Q80UU2 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpp38Q80UU2 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpp38Q80UU2 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpp38Q80UU2 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpp38Q80UU2 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpp38Q80UU2 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpp38Q80UU2 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpp38Q80UU2 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpp38Q80UU2 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpp38Q80UU2 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpp38Q80UU2 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpp38Q80UU2 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpp38Q80UU2 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpp38Q80UU2 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpp38Q80UU2 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpp38Q80UU2 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpp38Q80UU2 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpp38Q80UU2 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpp38Q80UU2 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpp38Q80UU2 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpp38Q80UU2 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpp38Q80UU2 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpp38Q80UU2 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpp38Q80UU2 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpp38Q80UU2 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpp38Q80UU2 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpp38Q80UU2 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpp38Q80UU2 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpp38Q80UU2 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpp38Q80UU2 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpp38Q80UU2 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpp38Q80UU2 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpp38Q80UU2 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpp38Q80UU2 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpp38Q80UU2 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpp38Q80UU2 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpp38Q80UU2 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpp38Q80UU2 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpp38Q80UU2 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpp38Q80UU2 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpp38Q80UU2 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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