Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH4

Ccp110, Centriolar coiled-coil protein of 110 kDa, mousemouse

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Length 1,004 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccp110Q7TSH4 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccp110Q7TSH4 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccp110Q7TSH4 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccp110Q7TSH4 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccp110Q7TSH4 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccp110Q7TSH4 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccp110Q7TSH4 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccp110Q7TSH4 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccp110Q7TSH4 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccp110Q7TSH4 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccp110Q7TSH4 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccp110Q7TSH4 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccp110Q7TSH4 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccp110Q7TSH4 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccp110Q7TSH4 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccp110Q7TSH4 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccp110Q7TSH4 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccp110Q7TSH4 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccp110Q7TSH4 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccp110Q7TSH4 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccp110Q7TSH4 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccp110Q7TSH4 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccp110Q7TSH4 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccp110Q7TSH4 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccp110Q7TSH4 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccp110Q7TSH4 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccp110Q7TSH4 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccp110Q7TSH4 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccp110Q7TSH4 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccp110Q7TSH4 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccp110Q7TSH4 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccp110Q7TSH4 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccp110Q7TSH4 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccp110Q7TSH4 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccp110Q7TSH4 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccp110Q7TSH4 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccp110Q7TSH4 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccp110Q7TSH4 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccp110Q7TSH4 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccp110Q7TSH4 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccp110Q7TSH4 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccp110Q7TSH4 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccp110Q7TSH4 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccp110Q7TSH4 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccp110Q7TSH4 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccp110Q7TSH4 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccp110Q7TSH4 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccp110Q7TSH4 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccp110Q7TSH4 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccp110Q7TSH4 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccp110Q7TSH4 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccp110Q7TSH4 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccp110Q7TSH4 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccp110Q7TSH4 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccp110Q7TSH4 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccp110Q7TSH4 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccp110Q7TSH4 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccp110Q7TSH4 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccp110Q7TSH4 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccp110Q7TSH4 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccp110Q7TSH4 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccp110Q7TSH4 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccp110Q7TSH4 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccp110Q7TSH4 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccp110Q7TSH4 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccp110Q7TSH4 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccp110Q7TSH4 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccp110Q7TSH4 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccp110Q7TSH4 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccp110Q7TSH4 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccp110Q7TSH4 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccp110Q7TSH4 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccp110Q7TSH4 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccp110Q7TSH4 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccp110Q7TSH4 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccp110Q7TSH4 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccp110Q7TSH4 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccp110Q7TSH4 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccp110Q7TSH4 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccp110Q7TSH4 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccp110Q7TSH4 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccp110Q7TSH4 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccp110Q7TSH4 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccp110Q7TSH4 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccp110Q7TSH4 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccp110Q7TSH4 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccp110Q7TSH4 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccp110Q7TSH4 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccp110Q7TSH4 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccp110Q7TSH4 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccp110Q7TSH4 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccp110Q7TSH4 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccp110Q7TSH4 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccp110Q7TSH4 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccp110Q7TSH4 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccp110Q7TSH4 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccp110Q7TSH4 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccp110Q7TSH4 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccp110Q7TSH4 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccp110Q7TSH4 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms