Protein–RNA interactions for Protein: Q78XR0

Trappc6a, Trafficking protein particle complex subunit 6A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6aQ78XR0 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Trappc6aQ78XR0 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Trappc6aQ78XR0 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Trappc6aQ78XR0 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Trappc6aQ78XR0 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
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Trappc6aQ78XR0 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc6aQ78XR0 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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