Protein–RNA interactions for Protein: Q78S06

Sys1, Protein SYS1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sys1Q78S06 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Sys1Q78S06 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms