Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc88cQ6VGS5 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc88cQ6VGS5 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc88cQ6VGS5 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc88cQ6VGS5 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc88cQ6VGS5 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc88cQ6VGS5 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc88cQ6VGS5 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc88cQ6VGS5 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc88cQ6VGS5 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc88cQ6VGS5 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc88cQ6VGS5 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc88cQ6VGS5 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc88cQ6VGS5 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc88cQ6VGS5 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc88cQ6VGS5 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc88cQ6VGS5 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc88cQ6VGS5 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc88cQ6VGS5 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc88cQ6VGS5 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc88cQ6VGS5 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc88cQ6VGS5 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc88cQ6VGS5 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc88cQ6VGS5 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc88cQ6VGS5 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc88cQ6VGS5 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc88cQ6VGS5 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc88cQ6VGS5 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc88cQ6VGS5 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc88cQ6VGS5 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc88cQ6VGS5 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc88cQ6VGS5 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc88cQ6VGS5 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc88cQ6VGS5 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc88cQ6VGS5 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc88cQ6VGS5 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc88cQ6VGS5 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc88cQ6VGS5 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc88cQ6VGS5 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc88cQ6VGS5 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc88cQ6VGS5 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc88cQ6VGS5 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc88cQ6VGS5 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc88cQ6VGS5 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc88cQ6VGS5 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc88cQ6VGS5 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc88cQ6VGS5 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc88cQ6VGS5 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc88cQ6VGS5 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc88cQ6VGS5 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc88cQ6VGS5 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc88cQ6VGS5 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc88cQ6VGS5 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc88cQ6VGS5 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc88cQ6VGS5 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc88cQ6VGS5 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc88cQ6VGS5 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc88cQ6VGS5 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc88cQ6VGS5 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc88cQ6VGS5 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc88cQ6VGS5 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc88cQ6VGS5 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc88cQ6VGS5 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc88cQ6VGS5 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc88cQ6VGS5 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc88cQ6VGS5 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc88cQ6VGS5 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc88cQ6VGS5 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc88cQ6VGS5 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc88cQ6VGS5 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc88cQ6VGS5 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc88cQ6VGS5 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc88cQ6VGS5 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc88cQ6VGS5 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc88cQ6VGS5 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc88cQ6VGS5 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc88cQ6VGS5 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc88cQ6VGS5 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc88cQ6VGS5 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc88cQ6VGS5 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc88cQ6VGS5 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc88cQ6VGS5 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc88cQ6VGS5 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc88cQ6VGS5 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms