Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

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Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Usp49Q6P9L4 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp49Q6P9L4 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp49Q6P9L4 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp49Q6P9L4 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Usp49Q6P9L4 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Usp49Q6P9L4 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp49Q6P9L4 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp49Q6P9L4 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Usp49Q6P9L4 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Usp49Q6P9L4 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp49Q6P9L4 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp49Q6P9L4 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp49Q6P9L4 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp49Q6P9L4 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp49Q6P9L4 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Usp49Q6P9L4 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp49Q6P9L4 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp49Q6P9L4 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp49Q6P9L4 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp49Q6P9L4 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp49Q6P9L4 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp49Q6P9L4 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Usp49Q6P9L4 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Usp49Q6P9L4 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Usp49Q6P9L4 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp49Q6P9L4 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp49Q6P9L4 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp49Q6P9L4 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms