Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4U0

Thsd7b, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 7B, mousemouse

Predictions only

Length 1,607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thsd7bQ6P4U0 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thsd7bQ6P4U0 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thsd7bQ6P4U0 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thsd7bQ6P4U0 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Thsd7bQ6P4U0 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Thsd7bQ6P4U0 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Thsd7bQ6P4U0 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thsd7bQ6P4U0 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Thsd7bQ6P4U0 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Thsd7bQ6P4U0 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thsd7bQ6P4U0 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thsd7bQ6P4U0 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thsd7bQ6P4U0 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thsd7bQ6P4U0 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thsd7bQ6P4U0 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Thsd7bQ6P4U0 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thsd7bQ6P4U0 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thsd7bQ6P4U0 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thsd7bQ6P4U0 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thsd7bQ6P4U0 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thsd7bQ6P4U0 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thsd7bQ6P4U0 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thsd7bQ6P4U0 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thsd7bQ6P4U0 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Thsd7bQ6P4U0 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Thsd7bQ6P4U0 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thsd7bQ6P4U0 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Thsd7bQ6P4U0 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Thsd7bQ6P4U0 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thsd7bQ6P4U0 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thsd7bQ6P4U0 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thsd7bQ6P4U0 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thsd7bQ6P4U0 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thsd7bQ6P4U0 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thsd7bQ6P4U0 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thsd7bQ6P4U0 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thsd7bQ6P4U0 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thsd7bQ6P4U0 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thsd7bQ6P4U0 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thsd7bQ6P4U0 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thsd7bQ6P4U0 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thsd7bQ6P4U0 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thsd7bQ6P4U0 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thsd7bQ6P4U0 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Thsd7bQ6P4U0 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thsd7bQ6P4U0 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thsd7bQ6P4U0 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thsd7bQ6P4U0 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thsd7bQ6P4U0 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thsd7bQ6P4U0 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thsd7bQ6P4U0 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thsd7bQ6P4U0 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thsd7bQ6P4U0 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Thsd7bQ6P4U0 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thsd7bQ6P4U0 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thsd7bQ6P4U0 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Thsd7bQ6P4U0 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Thsd7bQ6P4U0 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thsd7bQ6P4U0 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thsd7bQ6P4U0 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thsd7bQ6P4U0 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thsd7bQ6P4U0 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thsd7bQ6P4U0 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Thsd7bQ6P4U0 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thsd7bQ6P4U0 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thsd7bQ6P4U0 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thsd7bQ6P4U0 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thsd7bQ6P4U0 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thsd7bQ6P4U0 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thsd7bQ6P4U0 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thsd7bQ6P4U0 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thsd7bQ6P4U0 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Thsd7bQ6P4U0 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Thsd7bQ6P4U0 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Thsd7bQ6P4U0 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thsd7bQ6P4U0 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thsd7bQ6P4U0 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thsd7bQ6P4U0 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Thsd7bQ6P4U0 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thsd7bQ6P4U0 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Thsd7bQ6P4U0 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thsd7bQ6P4U0 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thsd7bQ6P4U0 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thsd7bQ6P4U0 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Thsd7bQ6P4U0 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thsd7bQ6P4U0 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thsd7bQ6P4U0 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thsd7bQ6P4U0 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Thsd7bQ6P4U0 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thsd7bQ6P4U0 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thsd7bQ6P4U0 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thsd7bQ6P4U0 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thsd7bQ6P4U0 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thsd7bQ6P4U0 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Thsd7bQ6P4U0 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thsd7bQ6P4U0 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thsd7bQ6P4U0 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thsd7bQ6P4U0 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thsd7bQ6P4U0 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Thsd7bQ6P4U0 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms