Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX4

Krt39, Keratin, type I cytoskeletal 39, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt39Q6IFX4 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt39Q6IFX4 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms