Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Krt40Q6IFX3 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Krt40Q6IFX3 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Krt40Q6IFX3 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Krt40Q6IFX3 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Krt40Q6IFX3 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Krt40Q6IFX3 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Krt40Q6IFX3 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
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Krt40Q6IFX3 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Krt40Q6IFX3 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt40Q6IFX3 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms