Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rftn1Q6A0D4 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rftn1Q6A0D4 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rftn1Q6A0D4 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rftn1Q6A0D4 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rftn1Q6A0D4 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rftn1Q6A0D4 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rftn1Q6A0D4 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rftn1Q6A0D4 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rftn1Q6A0D4 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rftn1Q6A0D4 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rftn1Q6A0D4 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rftn1Q6A0D4 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rftn1Q6A0D4 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rftn1Q6A0D4 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rftn1Q6A0D4 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rftn1Q6A0D4 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rftn1Q6A0D4 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rftn1Q6A0D4 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms