Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

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Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzrn3Q69ZS0 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzrn3Q69ZS0 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzrn3Q69ZS0 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzrn3Q69ZS0 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzrn3Q69ZS0 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzrn3Q69ZS0 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzrn3Q69ZS0 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzrn3Q69ZS0 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzrn3Q69ZS0 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdzrn3Q69ZS0 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzrn3Q69ZS0 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzrn3Q69ZS0 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzrn3Q69ZS0 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzrn3Q69ZS0 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzrn3Q69ZS0 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzrn3Q69ZS0 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzrn3Q69ZS0 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzrn3Q69ZS0 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzrn3Q69ZS0 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzrn3Q69ZS0 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzrn3Q69ZS0 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzrn3Q69ZS0 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzrn3Q69ZS0 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzrn3Q69ZS0 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzrn3Q69ZS0 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzrn3Q69ZS0 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzrn3Q69ZS0 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzrn3Q69ZS0 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzrn3Q69ZS0 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzrn3Q69ZS0 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzrn3Q69ZS0 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzrn3Q69ZS0 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzrn3Q69ZS0 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzrn3Q69ZS0 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzrn3Q69ZS0 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzrn3Q69ZS0 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzrn3Q69ZS0 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzrn3Q69ZS0 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzrn3Q69ZS0 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzrn3Q69ZS0 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzrn3Q69ZS0 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzrn3Q69ZS0 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzrn3Q69ZS0 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzrn3Q69ZS0 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdzrn3Q69ZS0 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdzrn3Q69ZS0 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdzrn3Q69ZS0 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdzrn3Q69ZS0 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdzrn3Q69ZS0 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdzrn3Q69ZS0 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdzrn3Q69ZS0 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdzrn3Q69ZS0 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdzrn3Q69ZS0 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdzrn3Q69ZS0 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdzrn3Q69ZS0 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdzrn3Q69ZS0 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdzrn3Q69ZS0 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdzrn3Q69ZS0 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdzrn3Q69ZS0 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdzrn3Q69ZS0 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdzrn3Q69ZS0 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdzrn3Q69ZS0 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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Pdzrn3Q69ZS0 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdzrn3Q69ZS0 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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Pdzrn3Q69ZS0 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdzrn3Q69ZS0 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdzrn3Q69ZS0 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdzrn3Q69ZS0 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
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Pdzrn3Q69ZS0 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdzrn3Q69ZS0 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdzrn3Q69ZS0 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdzrn3Q69ZS0 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdzrn3Q69ZS0 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdzrn3Q69ZS0 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdzrn3Q69ZS0 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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