Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZB0

Lrrcc1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrcc1Q69ZB0 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrcc1Q69ZB0 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms