Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z26

Cntn4, Contactin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn4Q69Z26 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cntn4Q69Z26 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cntn4Q69Z26 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cntn4Q69Z26 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cntn4Q69Z26 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cntn4Q69Z26 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cntn4Q69Z26 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cntn4Q69Z26 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cntn4Q69Z26 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cntn4Q69Z26 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cntn4Q69Z26 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cntn4Q69Z26 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cntn4Q69Z26 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cntn4Q69Z26 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cntn4Q69Z26 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cntn4Q69Z26 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cntn4Q69Z26 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cntn4Q69Z26 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cntn4Q69Z26 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cntn4Q69Z26 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cntn4Q69Z26 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cntn4Q69Z26 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cntn4Q69Z26 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cntn4Q69Z26 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cntn4Q69Z26 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cntn4Q69Z26 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cntn4Q69Z26 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cntn4Q69Z26 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cntn4Q69Z26 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cntn4Q69Z26 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cntn4Q69Z26 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cntn4Q69Z26 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cntn4Q69Z26 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cntn4Q69Z26 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cntn4Q69Z26 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cntn4Q69Z26 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cntn4Q69Z26 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cntn4Q69Z26 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cntn4Q69Z26 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cntn4Q69Z26 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cntn4Q69Z26 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cntn4Q69Z26 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cntn4Q69Z26 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cntn4Q69Z26 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cntn4Q69Z26 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cntn4Q69Z26 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cntn4Q69Z26 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cntn4Q69Z26 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cntn4Q69Z26 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cntn4Q69Z26 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cntn4Q69Z26 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cntn4Q69Z26 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cntn4Q69Z26 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cntn4Q69Z26 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Cntn4Q69Z26 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cntn4Q69Z26 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cntn4Q69Z26 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cntn4Q69Z26 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cntn4Q69Z26 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cntn4Q69Z26 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cntn4Q69Z26 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cntn4Q69Z26 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cntn4Q69Z26 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cntn4Q69Z26 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cntn4Q69Z26 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cntn4Q69Z26 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cntn4Q69Z26 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cntn4Q69Z26 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cntn4Q69Z26 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Cntn4Q69Z26 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cntn4Q69Z26 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Cntn4Q69Z26 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cntn4Q69Z26 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cntn4Q69Z26 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cntn4Q69Z26 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Cntn4Q69Z26 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cntn4Q69Z26 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cntn4Q69Z26 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cntn4Q69Z26 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cntn4Q69Z26 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cntn4Q69Z26 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cntn4Q69Z26 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cntn4Q69Z26 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cntn4Q69Z26 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cntn4Q69Z26 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cntn4Q69Z26 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cntn4Q69Z26 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cntn4Q69Z26 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cntn4Q69Z26 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cntn4Q69Z26 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cntn4Q69Z26 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cntn4Q69Z26 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cntn4Q69Z26 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cntn4Q69Z26 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cntn4Q69Z26 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cntn4Q69Z26 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Cntn4Q69Z26 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cntn4Q69Z26 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cntn4Q69Z26 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cntn4Q69Z26 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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