Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkp4Q68FH0 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms